Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms