Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms