Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabpaQ00422 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms