Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabpb1Q00420 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabpb1Q00420 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms