Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt3Q00342 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms