Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms