Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PgrQ00175 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms