Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp10Q000W5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms