Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AlkP97793 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AlkP97793 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AlkP97793 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AlkP97793 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AlkP97793 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AlkP97793 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AlkP97793 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms