Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms