Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcc1P97496 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms