Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bop1P97452 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms