Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SmsP97355 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SmsP97355 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SmsP97355 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SmsP97355 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SmsP97355 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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SmsP97355 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SmsP97355 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms