Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkdcP97313 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms