Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim43bP86448 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms