Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgcgP82348 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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