Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb2P81069 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms