Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx2P81066 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx2P81066 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx2P81066 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms