Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Otx1P80205 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms