Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufd1P70362 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufd1P70362 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms