Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad1P70340 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms