Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbx6P70327 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms