Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprvP70289 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprvP70289 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PtprvP70289 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprvP70289 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprvP70289 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms