Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxd13P70217 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hoxd13P70217 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxd13P70217 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxd13P70217 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxd13P70217 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxd13P70217 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxd13P70217 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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