Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl39P62892 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms