Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps28P62858 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps28P62858 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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