Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms