Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms