Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms