Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actr1aP61164 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms