Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf1P61148 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf1P61148 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms