Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2kP61087 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms