Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms