Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ythdf1P59326 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms