Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms