Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf2P59222 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms