Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp1P59110 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp1P59110 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp1P59110 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp1P59110 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms