Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtnsP57757 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms