Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmoP56726 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmoP56726 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmoP56726 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmoP56726 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SmoP56726 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SmoP56726 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms