Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms