Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp5P56399 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms