Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1P56183 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms