Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a1P55014 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms