Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndst2P52850 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst2P52850 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms