Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr1cP52432 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1cP52432 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms