Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms