Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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