Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RorcP51450 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RorcP51450 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RorcP51450 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms