Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnt2P50752 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms