Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa10P50708 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms